生物工程专业建于2015年，旨在培养具有生命科学的基础理论、生物技术及其产业化的基本原理及工程工艺技术过程，能够在生物工程与产业发展领域从事设计、生产、管理和新技术研究、新产品开发的工程技术人才。该专业在注重向学生传授理论知识的同时，更加重视学生工程工艺技术及实践能力的培养，注重学生一线实践能力的锻炼和对生物相关产业和产品的开发意识和能力。在基础和基本理论课程的基础上，设置了师资型、发酵工程、环境生物工程和食品工程模块，拓宽了学生就业渠道。同时通过两个学期的实习实践培养学生实践创新能力和就业竞争力。